Bifidobacteriales ist eine Ordnung von Bakterien , [1] in der Unterklasse der Actinobacteridae .
| Bifidobakterien | |
|---|---|
 | |
| Bifidobacterium teenageris | |
Wissenschaftliche Klassifikation  | |
| Domain: | Bakterien |
| Stamm: | Aktinobakterien |
| Klasse: | Aktinobakterien |
| Auftrag: | Bifidobacteriales Stackebrandt et al. 1997 erneuern. Zhiet al. 2009 |
Familie und Genera
- Bifidobacteriaceae
- Aeriscardovia
- Alloskardovia
- Bifidobakterium
- Bombiscardovia
- Galliskardovia
- Gardnerella
- Neoscardovia
- Parascardovia
- Pseudoscardovia
- Scardovia
- incertae sedis
Genomik
In einem phylogenetischen Baum für die Ordnung Bifidobacteriales , basierend auf RpoB , RpoC und DNA Gyrase B , verzweigt sich Gardnerella vaginalis zwischen verschiedenen Bifidobacterium- Arten, was die Gattung Bifidobacterium polyphyletisch macht . Die Gattung könnte monophyletisch gemacht werden, wenn G. vaginalis innerhalb von Bifidobacterium platziert wurde . Eine vergleichende Analyse von ausgerichteten Proteinsequenzen hat zur Entdeckung von zwei konservierten Signaturindels geführt, die spezifisch für die Ordnung Bifidobacteriales sind . Das erste Indel , eine Deletion von 1 Aminosäure im ribosomalen Protein L13 , wird in allen Bifidobacteriales- Spezies und keinen anderen Actinobakterien gefunden , was einen potentiellen molekularen Marker für die gesamte Bifidobacteriales- Ordnung darstellt. Das zweite identifizierte Indel ist eine 1-Aminosäure-Insertion in Glucose-6-Phosphat-Dehydrogenase, die in allen Bifidobacterium- Spezies und G. vaginalis , aber nicht in anderen Actinobakterien gefunden wird . Dieses Indel ist somit charakteristisch für die Klade bestehend aus Bifidobacterium- Spezies und G. vaginalis und kann verwendet werden, um diese Gattungen vom Rest der Ordnung Bifidobacteriales zu unterscheiden . Es wurden auch 16 konservierte Signaturproteine identifiziert, die für die Ordnung Bifidobacteriales einzigartig sind und als molekulare Marker für diese Ordnung verwendet werden können. Darüber hinaus wurden 6 konservierte Signaturproteine identifiziert, die einzigartig für Bifidobacterium und Gardnerella sind, was weitere Beweise dafür liefert, dass Arten dieser beiden Gattungen eng verwandt sind und molekulare Marker für die aus diesen Gattungen bestehende Klade liefern. [2]
Verweise
- ^ Krogius-Kurikka L, Kassinen A, Paulin L, et al. (2009). "Sequenzanalyse von prozentualen G+C-Fraktionsbibliotheken menschlicher fäkaler bakterieller DNA zeigt eine hohe Anzahl von Actinobakterien" . BMC-Mikrobiol . 9 : 68. doi : 10.1186/1471-2180-9-68 . PMC 2679024 . PMID 19351420 .
- ^ Gao, B.; Gupta, RS (2012). "Phylogenetic Framework und molekulare Signaturen für die Hauptclades des Phylum Actinobacteria" . Mikrobiologie und Molekularbiologie Bewertungen . 76 (1): 66–112. doi : 10.1128/MMBR.05011-11 . PMC 3294427 . PMID 22390973 .
Externe Links
- Systema Naturae 2000 / Klassifizierung - Ordnung Bifidobacteriales
